La squadra di calcio Gibuti U20 rappresenta Gibuti nelle competizioni internazionali di calcio a livello Under-20. È controllata dalla Federazione calcistica di Gibuti.
La squadra ha partecipato per la prima volta al Campionato africano giovanile di calcio nel 2005, quando è stata eliminata al primo turno. Da allora, non si è più qualificata per il torneo.
La squadra ha partecipato anche alla Coppa del mondo FIFA Under-20 per la prima volta nel 2007, quando è stata eliminata al primo turno. Nel 2009, ha nuovamente partecipato al torneo, ma è stata nuovamente eliminata al primo turno.
La squadra è attualmente guidata dall'allenatore Ahmed El-Asfar.
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